NOA er en forening. Det er ingen lover som regulerer denne organisasjonsform i Norge. Foreningene står dermed temmelig fritt til å bestemme formål og organisering. NOAs formål og organisasjon er fastsatt i vedtektene.

NOA er som forening en selvstendig juridisk enhet med eget styre og egen økonomi. NOA er tilsluttet et landsforbund; Norges Naturvernforbund, og Oslo og omland friluftsråd (OOF).Organisasjonen fremgår av vedtektene, og består av årsmøte, styre, lokallag og sekretariat.

Årsmøtet er NOAs høyeste organ. Her legger styret frem et årsprogram som med eller uten endringer vedtas av årsmøtet og danner grunnlaget for NOAs virksomhet kommende år. Det ligger i sakens natur at årsprogrammet må være så fleksibelt at NOA kan ha handlefrihet i til å ytre seg i de naturvernssaker som til enhver tid er aktuelle for NOA å engasjere seg i.

Styret representerer NOA mellom årsmøtene og fatter vedtak i alle saker som ikke etter vedtekten er tillagt årsmøte.

Lokallagene er selvstendige organisasjoner med eget geografisk område og med eget årsmøte, styre og økonomi. I faglige spørsmål som omfatter flere lag eller er av prinsipiell natur foretas det en samordning i NOAs område.